恒溫培養搖床是一種高速運轉的機型設備，初次使用時應該首先檢查搖床的腳座有沒有墊平，尤其是在水泥地和地磚地上使用時應該在搖床的腳座下墊上減震墊，如果沒有減震墊的話也可用橡膠墊或者防滑地墊替代，這樣就可以增加搖床的腳和地板的摩擦力，防止搖床在高速運轉時移位。另外，有些用戶在使用恒溫培養搖床的過程中怕麻煩往往忽視對夾具的保護，合理的使用方法是在三角瓶上包一層紗布，這樣就可以減輕瓶子和夾具的摩擦，防止夾具的磨損，也可以減輕瓶子和夾具碰撞產生的噪音。